1. Las particiones se desmontan solas si no las configuras.
2. Algunas aplicaciones deben de ser instaladas por Terminal cosa que muy pocos saben usar .
3 . No corren Archivos .Exe almenos que tengas wine y maquina virtual un recurso que muy pocos saben usar .
Seguire Actualizando este post .
THE CHILIN 
Ventajas de ubuntu o otro sistema operativo derivado de debian:
1.- Son software libre, por ende no tienes que pagar licencias, es distribuido gratuitamente.
2.- Tienes la libertad de ejecutarlo como desees.
3.- Como es software libre, puedes estudiar su código.
4.- Puedes hacer copias de tus versiones modificadas y distribuirlas entre los demás. Osea puedes crear tu propia distribución.
5.- Es más seguro y menos propenso a ser infectado por un virus, casi que nulo, en comparación con windows.
Unas observaciones:
– En cuanto a lo que comentas sobre las particiones es falso, no se desmontan solas.
– Instalar una aplicación por consola no es complicado, con escribir «apt-get install aplicación» basta. En lo personal es mas fácil que darle siguiente, siguiente, siguiente como en windows.
– No corren archivos .exe obviamente porque es otro sistema operativo y es una codificación diferente, esto no es una desventaja, puedes tener google chrome en un equipo windows y ubuntu, en el primero lo instalas con un .exe y en el segundo con un .deb.
Saludos,
Moisés